Statens Jordbruksverk är förvaltningsmyndighet för programmet. Länsstyrelserna och Sametinget är stödmyndigheter som handlägger inkomna ärenden och fattar beslut. Samiska projektägare och företag ska vända sig till Sametinget.
Sametingets genomförandestrategi
Sametinget har en genomförandestrategi för hur företags- och projektstöd, stöd till kompetensutveckling och utvald miljö ska fördelas för att nå bästa effekt. Denna strategi bygger på det näringspolitiska handlingsprogrammet som utarbetats i samråd med samiskt näringsliv, ideella organisationer m fl och antagits av plenum. Ansökningarna prioriteras efter